In der 2. Staffel trat er der Besetzung der TV-Show Star Trek Picard bei. Er erhielt eine Einladung von Terry Matalas, der ihn anrief und fragte, ob er auf einen Anruf gewartet habe. Er dachte darüber nach, wenn man bedenkt, dass die ursprüngliche Besetzung von Star Trek vier Filme ohne ihn gedreht hatte und die erste Staffel der Serie bereits gedreht war und er, um ehrlich zu sein, nicht mit dem Anruf gerechnet hatte. Terry fragte ihn, ob er irgendwelche Fragen hätte, worauf John antwortete: „Ja, wenn ich wieder die enge Uniform tragen muss, dann ist der Deal gescheitert.“
Er hatte noch einige ernste Fragen an ihn, versucht ihr „Q“ in die Serie fortschreiben oder wollt ihr „Q“ neu erfinden und die Antwort war sie wollen nicht zurückschauen und etwas Neues erschaffen, sondern seine Rolle vertiefen.
Zu Beginn der Dreharbeiten zur zweiten Staffel konnte er nur einen Tag arbeiten, bis ein Crewmitglied der Make-up-Abteilung positiv auf COVID getestet wurde und die Dreharbeiten für zwei Wochen auf Eis gelegt wurden. Kurz darauf erkrankte Patrick Stewart und es kam zu einer weiteren Pause. Alle trugen Masken und es fand nur die notwendige Kommunikation statt, wobei die geringste Anzahl an Personen am Set anwesend war. Er freute sich riesig, als am letzten Drehtag bei einer nur einstündigen Szene mit Patrick insgesamt 12 Leute anwesend und am Ende 30 Leute da waren, um sich von ihm und Patrick zu verabschieden. COVID hat die Beziehungen während der Zeit des Shut-Downs belastet, aber es war schön zu sehen, dass am Ende alle den Wunsch verspürten, wieder zusammen zu sein.
Im Laufe der Jahre hatte John die Gelegenheit, Teil verschiedener Star Trek Serien zu sein und mit jedem Kapitän persönliche Kontakte zu knüpfen. Er bekam eine blutige Nase, als er Sisko traf, er teilte eine Badewanne mit Janeway und sogar ein Bett mit Picard. Seine Favoriten sind Kate und Patrick, weil er im wirklichen Leben immer noch mit Kate befreundet ist und ihre Charaktere nie eine romantische Beziehung hatten, aber sie pflegten das Publikum damit zu necken. Er mag Patrick, weil ihre Rollen klar definierten, wer in jeder Szene der Gewinner war.
Zum Glück kam es zur Sprache, dass er in Breaking Bad eine fabelhafte Rolle hatte und dort Donald Margolis spielte, welcher eine Drogen abhängige Tochter hatte. Leider starb sie an einer Überdosis und er musste das alles verarbeiten. Er hatte Jahre, nach dem er die Rolle gespielt, Kontakt mit einer 20 Jahren alten Person, welche dieselben Schwierigkeiten durchlebte, getroffen. Diese sagte John, dass ihm die Serie gezeigt habe, welches Leid er mit seinem Tun anderen Menschen zufügt, gerade seinen Eltern. Daraufhin hat er sich besonnen und entschieden, dieses Leben aufzugeben. So etwas hinterlässt immer ein gutes Gefühl, etwas erreicht zu haben und soviel Energie in eine Rolle zu stecken.
